More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2446 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  71.92 
 
 		 146 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  40.86 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  32.5 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  40.86 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  43.21 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 157 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.83 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 173 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  31.73 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 190 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 138 aa  57  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.6 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  36.46 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  35.35 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1648  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.602614 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01812  transcriptional regulator, MarR family protein  36.84 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000102979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  29.59 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 152 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 174 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  31.93 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  27.66 
 
 		 158 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2651  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 156 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  40.4 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0611  transcriptional regulator of MarR family protein  32.67 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.320818  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  24.56 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 219 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>