More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2060 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  288  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  45.99 
 
 		 143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  45.8 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  44.7 
 
 		 149 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.36 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  38.73 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45.65 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  39.47 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.47 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  36.96 
 
 		 156 aa  64.3  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1878  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.147692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  34.07 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  39.05 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  32.8 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  39.83 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  37.25 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  31.25 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  38.05 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  37.16 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>