More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34620 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  100 
 
 		 149 aa  290  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  60.45 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  40.56 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  41.3 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  33.62 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  38.68 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.74 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  33.82 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 174 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  36.14 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  32.38 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  34.11 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.65 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.74 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.3 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 152 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 192 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 165 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 171 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 189 aa  51.6  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 172 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  29.58 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 164 aa  50.1  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 165 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.86 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 172 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 190 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 144 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>