More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3057 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  310  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  33.77 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  67  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 143 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 175 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  43.96 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 165 aa  57  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  31.62 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.79 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 147 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.45 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.48 
 
 		 171 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 149 aa  51.2  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.11 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  30.88 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  34.58 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4415  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.75195  normal  0.537773 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  30.82 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5532  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 175 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.008053  hitchhiker  0.0000039263 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  30.71 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0868  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.910942  normal  0.3446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>