205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3272 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  270  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 162 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  47.24 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 151 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 159 aa  87.4  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 151 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 144 aa  73.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 163 aa  71.6  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  44.29 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.59 
 
 		 144 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 150 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.86 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 150 aa  57.8  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  35.88 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.7 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  37.93 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.64 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  35.81 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000535  putative transcription regulator  32.59 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  45.9 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 173 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 173 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  28.97 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>