More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1517 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1517  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  0.0147514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1584  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  283  8e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.119163  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 141 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 156 aa  157  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2621  MarR family transcriptional regulator  57.66 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.276728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  55.4 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1685  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 196 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.402727  normal  0.628244 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1648  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 191 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.575498  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1597  MarR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2695  transcriptional regulator, MarR family  55.38 
 
 		 172 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.21037  hitchhiker  0.0000565476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1663  MarR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  48.82 
 
 		 163 aa  135  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0934  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 163 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3331  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.376124  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 165 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.24 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 165 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3621  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.597701 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 165 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  48.03 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  45.67 
 
 		 143 aa  123  7e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  43.7 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 165 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3161  regulatory protein, MarR  45.8 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0336123  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 168 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  44.88 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0374  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00135193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  41.13 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  39.52 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 154 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  42.4 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  42.4 
 
 		 146 aa  108  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  45.38 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  42.4 
 
 		 146 aa  107  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  40.15 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  42.28 
 
 		 170 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  42.74 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1113  transcriptional regulator, TrmB  39.2 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  41.13 
 
 		 158 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  39.52 
 
 		 166 aa  104  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2151  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  42.28 
 
 		 162 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  43.09 
 
 		 155 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 185 aa  103  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  39.2 
 
 		 151 aa  102  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  40.94 
 
 		 149 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  39.39 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21070  transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4792  transcriptional regulator, MarR family  43.64 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0729618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1936  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 155 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20780  transcriptional regulator, MarR family  41.73 
 
 		 152 aa  100  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  39.55 
 
 		 178 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  41.04 
 
 		 152 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  35.29 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  39.2 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>