More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1650 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  301  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 147 aa  106  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  51.09 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 150 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 151 aa  99.8  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  48.65 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  43.18 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 150 aa  88.6  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 139 aa  87.4  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 150 aa  85.1  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 162 aa  84.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 162 aa  84.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 150 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  43.57 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  45.71 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.81 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  40.44 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  37.27 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.94 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.93 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 150 aa  62  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.68 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  35.88 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  36.84 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  33.33 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  39.05 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 147 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.146884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>