More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0877 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  322  9e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 150 aa  113  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  41.22 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 141 aa  90.5  9e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 151 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 145 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1224  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000414695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 148 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 142 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  25.69 
 
 		 161 aa  60.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.07 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2146  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.756264  normal  0.322548 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  34.58 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.11 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 150 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 156 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  29.23 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 157 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>