More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2751 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 147 aa  286  7e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  40.16 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  35.11 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 161 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 174 aa  61.6  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 136 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2611  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000027069  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  57  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  31.65 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  30.16 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 169 aa  54.3  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  40.23 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06415  transcriptional regulator marR family protein  28.15 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 186 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 175 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  41.05 
 
 		 146 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  34.83 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 151 aa  52.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  35.65 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 150 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 185 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  39.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.87 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  42.59 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0188  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291121 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  33.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 151 aa  50.8  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 171 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0194  hypothetical protein  39.58 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 213 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>