More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5248 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  290  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  290  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  290  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  40.16 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 170 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  43.52 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4510  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.88228  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 168 aa  67.8  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 167 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 155 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 170 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 148 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.33 
 
 		 157 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  33.57 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  48.72 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  44.19 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  42.11 
 
 		 185 aa  60.8  0.000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0109  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.701478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 158 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 166 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.91 
 
 		 261 aa  60.5  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  42.17 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  34.17 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 174 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>