More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1511 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 175 aa  353  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  60.25 
 
 		 201 aa  194  8.000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  58.39 
 
 		 194 aa  187  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  56 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  54 
 
 		 187 aa  174  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 186 aa  173  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 168 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 167 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 162 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 162 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 163 aa  147  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 161 aa  147  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 204 aa  122  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.11 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 157 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 157 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  46.4 
 
 		 164 aa  111  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 161 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 164 aa  91.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.44 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 167 aa  64.3  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.05 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 		 174 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.05 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.21 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  37.17 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  34.69 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  37.5 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35 
 
 		 261 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 142 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2484  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.105548  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3624  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>