More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5039 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  323  7e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  81.7 
 
 		 161 aa  263  8e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  78.15 
 
 		 158 aa  245  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 163 aa  238  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  58.44 
 
 		 162 aa  184  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  61.22 
 
 		 168 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  57.72 
 
 		 187 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 185 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  57.05 
 
 		 186 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 203 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  53.02 
 
 		 201 aa  160  7e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  53.06 
 
 		 194 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  53.06 
 
 		 194 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.67 
 
 		 186 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  30.2 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  30.2 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  31.65 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  34.93 
 
 		 172 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30.3 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 167 aa  66.2  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.56 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0069  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.62 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  28.36 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 191 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2410  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0478881  normal  0.0157959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  29.32 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  31 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5309  Transcriptional regulator  30.5 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00683555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0902  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  40.19 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  36.14 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  37.35 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  30.3 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>