More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3618 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  320  6e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  83.12 
 
 		 161 aa  267  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  78.15 
 
 		 158 aa  245  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  70.37 
 
 		 163 aa  229  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  61.33 
 
 		 162 aa  189  1e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  64.19 
 
 		 168 aa  184  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 167 aa  180  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  60.53 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 185 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  60.53 
 
 		 186 aa  177  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  56.46 
 
 		 162 aa  171  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  55.78 
 
 		 203 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  53.06 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  51.7 
 
 		 194 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  51.7 
 
 		 194 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  52.74 
 
 		 175 aa  150  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 204 aa  127  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  42.48 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 167 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 161 aa  111  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  41.75 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  41.75 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  41.75 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  39.25 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  35.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  40.4 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  32.19 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.66 
 
 		 174 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  34.45 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  30.08 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.4 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 166 aa  58.5  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  30.41 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  33.33 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 148 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  31.75 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  43.06 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4638  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.747494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  30 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  46.97 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>