More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2693 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 157 aa  310  5.999999999999999e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 162 aa  123  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 186 aa  120  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5039  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0592  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  44.83 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 186 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  41.78 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  44.3 
 
 		 194 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 163 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 203 aa  111  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 185 aa  111  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  47.15 
 
 		 201 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1325  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 157 aa  101  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2276  MarR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 161 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3240  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.46 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  33.8 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1184  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 168 aa  65.1  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.535813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3511  transcriptional regulator, MarR family  37.19 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.982804  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  39.39 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  35.11 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2122  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 169 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000649422  normal  0.111554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  30.46 
 
 		 175 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  31.18 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 		 173 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07430  transcriptional regulator  33.06 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2254  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0799585  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4520  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.664155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  27.1 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2454  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1933  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1567  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3914  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 137 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  35.59 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1590  regulatory protein, MarR  33.04 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.298967  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 180 aa  52.4  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  26.67 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 142 aa  52.4  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 167 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3341  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.401369  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.9 
 
 		 157 aa  52  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>