More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0637 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
170 aa  342  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  80.95 
 
 
173 aa  278  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  67.07 
 
 
185 aa  223  1e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
168 aa  191  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3067  transcriptional regulator, MarR family  59.28 
 
 
166 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10751  transcriptional regulator  56.52 
 
 
165 aa  187  9e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000005234  normal  0.216403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3651  MarR family transcriptional regulator  57.67 
 
 
207 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  53.33 
 
 
167 aa  184  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  56.88 
 
 
165 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  57.23 
 
 
180 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
185 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
167 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  54.6 
 
 
185 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  51.53 
 
 
179 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  50.31 
 
 
168 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  49.4 
 
 
166 aa  152  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
174 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
167 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  50.91 
 
 
178 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  50.94 
 
 
170 aa  148  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 
181 aa  147  9e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  50.31 
 
 
162 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  47.02 
 
 
177 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  47.02 
 
 
173 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  47.83 
 
 
177 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 
172 aa  84  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8699  transcriptional regulator, MarR family  38.13 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
138 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5658  putative transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
170 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401607  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 
150 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4184  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
205 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
172 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  33.11 
 
 
158 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  42.45 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  40.35 
 
 
175 aa  57.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  31.25 
 
 
155 aa  57.8  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
155 aa  57  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  45.57 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4209  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.6 
 
 
154 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0686  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
160 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6405  Transcriptional regulators-like protein  33.09 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293573  normal  0.032419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
157 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1154  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.246648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2120  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401109  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  37 
 
 
185 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0255  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1595  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000929046  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
168 aa  55.5  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
157 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1975  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0792948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1958  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0906  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
164 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.670814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 
170 aa  54.7  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
172 aa  54.7  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  27.75 
 
 
155 aa  54.3  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  31.65 
 
 
162 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
170 aa  54.3  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.1 
 
 
173 aa  53.9  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4243  putative transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
171 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0515432 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
176 aa  53.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  35.77 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
168 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  35.14 
 
 
157 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2635  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
146 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  25.83 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3848  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 
325 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.169227  normal  0.0322518 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4490  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  35.96 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
151 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
172 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
189 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
141 aa  52  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4553  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
147 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
140 aa  52  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>