More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3217 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  46.76 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
156 aa  88.2  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  40.29 
 
 
156 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  39.64 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  39.2 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
175 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  38.02 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
159 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.82 
 
 
143 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  36.96 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  34.59 
 
 
162 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  40.3 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  41.09 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
157 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.74 
 
 
151 aa  69.7  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
146 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  39.39 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  39.1 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  39.62 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
149 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
152 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
171 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
171 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  35.42 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
144 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  44.58 
 
 
154 aa  60.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 
147 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  45.05 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
146 aa  58.2  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
167 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
161 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
156 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  33.58 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
151 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
161 aa  52.8  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
161 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>