More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0856 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 146 aa  283  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  91.1 
 
 		 146 aa  255  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 171 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 152 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  77.03 
 
 		 171 aa  214  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  67.13 
 
 		 208 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  38.97 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  43.55 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 143 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 146 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 139 aa  72  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  46.08 
 
 		 157 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  39.25 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  42.45 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.28 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 150 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  40.71 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.4 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  40.43 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  40.78 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.25 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  31.67 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 173 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 150 aa  57  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.6 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.8 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.72 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  40.2 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 212 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 193 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>