More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6119 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  100 
 
 		 138 aa  265  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  81.06 
 
 		 142 aa  206  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  59.83 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.48 
 
 		 161 aa  80.1  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  45.53 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 150 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  42.86 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  40.78 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 173 aa  67  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  46.61 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  40.62 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.18 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  40.95 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38.78 
 
 		 172 aa  57  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 146 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  38.06 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.72 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  37.98 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 157 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5540  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.790437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  34.96 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  35.25 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  41.05 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 152 aa  52  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  38.02 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  38.38 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3624  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.112718  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4743  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  hitchhiker  0.006335 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 152 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  40 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 152 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  39.29 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  44.44 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  37.96 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>