More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0505 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
149 aa  288  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  95.1 
 
 
144 aa  267  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  48.99 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
143 aa  123  9e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  54.89 
 
 
143 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  55.05 
 
 
147 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  48.85 
 
 
148 aa  118  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  48.12 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
144 aa  116  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  52.73 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  43.38 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  48.12 
 
 
158 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  49.26 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  50.37 
 
 
139 aa  106  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  46.58 
 
 
157 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  45.99 
 
 
152 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  45.45 
 
 
146 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
161 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 
145 aa  98.6  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  45.04 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  49.26 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.88 
 
 
145 aa  92  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  42.64 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
156 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
147 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  39.26 
 
 
146 aa  75.9  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
150 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  34.09 
 
 
163 aa  73.9  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
159 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
159 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  37.68 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.85 
 
 
157 aa  70.9  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.93 
 
 
161 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.06 
 
 
159 aa  70.1  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
173 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  38.51 
 
 
147 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
140 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
161 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 
139 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
167 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
155 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
143 aa  61.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
147 aa  60.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  37.62 
 
 
163 aa  60.8  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
175 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
152 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
171 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.06 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  35.06 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  35.06 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
208 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.43 
 
 
171 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 
146 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>