More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13520 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  319  9.000000000000001e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  43.54 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  46.73 
 
 		 150 aa  92.8  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  42.54 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  45.19 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  38.17 
 
 		 152 aa  89  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  45.79 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 144 aa  87  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  42.72 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 141 aa  84.7  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 143 aa  84  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  36.64 
 
 		 148 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  39.32 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  41.75 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 149 aa  73.9  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  39.5 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  45.12 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  41.49 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 155 aa  67.4  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  39.81 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4301  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39.17 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  36.49 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  43.37 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  36.24 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  35.71 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  36.51 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  36.9 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 156 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  34.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  35.8 
 
 		 156 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>