More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2297 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  100 
 
 
160 aa  311  1.9999999999999998e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 
151 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  40.28 
 
 
168 aa  93.6  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
161 aa  63.5  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 
161 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
141 aa  61.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
149 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  42.16 
 
 
172 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
165 aa  58.9  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  43.59 
 
 
178 aa  57.4  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
146 aa  57.4  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
167 aa  57  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.5 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  38.78 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_774  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.489268  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
137 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
158 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  35.09 
 
 
162 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
157 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
151 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  47.06 
 
 
138 aa  54.3  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
157 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
137 aa  53.9  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 
189 aa  53.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
167 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
152 aa  53.5  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3628  hypothetical protein  36.73 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0952966  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
173 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
162 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
159 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
168 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  37.37 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
185 aa  52  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3404  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
120 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 
148 aa  52  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
158 aa  52  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
150 aa  52  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  38.66 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.33 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  28.45 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
148 aa  51.2  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  27.43 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 
156 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
148 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  38.04 
 
 
137 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 
137 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  41.3 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 
156 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  38.16 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  39.19 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
154 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  51.92 
 
 
145 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  41.18 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3272  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2077  transcriptional regulator of MarR family protein  36.36 
 
 
161 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.323621  normal  0.679444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>