More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4437 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  100 
 
 		 168 aa  331  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  52.67 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  40.28 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  40.37 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  38.18 
 
 		 157 aa  62  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  41.18 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.97 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  54.3  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0270  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  42.5 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  42.5 
 
 		 157 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  41.57 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 148 aa  53.1  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  28.32 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1051  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00706994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 138 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  42.71 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 189 aa  52  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 142 aa  52  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 185 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 149 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4545  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.257542 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 153 aa  51.2  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  38.1 
 
 		 143 aa  51.2  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 170 aa  50.8  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3365  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 161 aa  50.8  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.559351  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 152 aa  50.8  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 142 aa  50.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 155 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 187 aa  50.8  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 149 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  39.73 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  38.36 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2562  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  38.96 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  20 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 137 aa  49.3  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 160 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 174 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>