More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_3912 on replicon NC_010184
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  95.33 
 
 
150 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  95.33 
 
 
150 aa  295  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  95.68 
 
 
139 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  94.96 
 
 
139 aa  271  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  94.96 
 
 
139 aa  271  3e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  94.96 
 
 
139 aa  270  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  94.24 
 
 
139 aa  268  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  94.24 
 
 
139 aa  268  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  93.53 
 
 
139 aa  266  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  89.21 
 
 
139 aa  256  8e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  48.89 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  47.01 
 
 
139 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
145 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  31.16 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
152 aa  70.5  0.000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
150 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  23.39 
 
 
151 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  30.1 
 
 
147 aa  62.8  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
165 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
182 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
165 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
150 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
156 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
165 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  60.1  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
178 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
180 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 
162 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
151 aa  58.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
160 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1113  transcriptional regulator, TrmB  31.76 
 
 
191 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
142 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
163 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25.98 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
163 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
180 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.703331 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  43.48 
 
 
153 aa  57.4  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
148 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
147 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>