More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3064 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  320  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  94.34 
 
 		 159 aa  299  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  92.45 
 
 		 173 aa  293  7e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 147 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2735  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.312377  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  26.62 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 181 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  31.86 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  28.7 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 163 aa  51.6  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  28.74 
 
 		 161 aa  51.2  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.22 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 158 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 140 aa  50.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  37.33 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>