More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3575 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 173 aa  347  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 154 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3470  regulatory protein MarR  35.83 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  36.57 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  34.82 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 148 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 148 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  35.42 
 
 		 161 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 148 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0881  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 168 aa  64.3  0.0000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0472  transcriptional regulator, MarR family  49.37 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0344  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603295  normal  0.222787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1188  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0809  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 153 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6536  transcriptional regulatory protein  34.21 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0217345  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3554  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 147 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  48.44 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2959  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000427838 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0643  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 151 aa  57.4  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0797969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1669  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.407714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19380  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0892459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30230  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.178176 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4616  transcriptional regulator, MarR family  40.82 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172446  hitchhiker  0.00038288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0945  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0115  regulatory protein, MarR  37.37 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0627652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0991  transcriptional regulator, MarR family  42.65 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1400  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.67 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3629  transcriptional regulator, MarR family  31.48 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2948  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  32.17 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  25.71 
 
 		 140 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 173 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3007  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  28.21 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  28.57 
 
 		 177 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2084  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3333  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 174 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 142 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  51.02 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0550  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4976  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 149 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2713  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>