More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1197 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
182 aa  361  3e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  38.62 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  39.16 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  40.44 
 
 
171 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
164 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
164 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
163 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 
178 aa  64.7  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
139 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
139 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
139 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
139 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
150 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1443  MarR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
178 aa  62.4  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 
162 aa  61.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
142 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
157 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 
164 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
157 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
195 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
157 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3575  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
173 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.545174  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 
159 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.12 
 
 
147 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
152 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 
146 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 
139 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.5 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
152 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  34.26 
 
 
155 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  35.34 
 
 
177 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
163 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.16 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  39.09 
 
 
147 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
145 aa  55.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
162 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
157 aa  54.7  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
181 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 
149 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
145 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
180 aa  53.9  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 
151 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  25.33 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  39.73 
 
 
150 aa  53.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
158 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  34.29 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
145 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  33.68 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  32.81 
 
 
157 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
177 aa  53.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  32.41 
 
 
174 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  32.65 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>