More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1453 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 143 aa  278  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 152 aa  97.1  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  37.5 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  37.5 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  32.29 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 150 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  41.67 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  43.84 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.19 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  35.42 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 159 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.77 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  33.93 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1079  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2143  regulatory protein, MarR  30.97 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.46 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  36.54 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2531  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2642  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  36.67 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.97 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0544  regulatory protein MarR  29.84 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  21.82 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 160 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>