More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3401 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 163 aa  335  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  30.6 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 139 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  29.6 
 
 		 144 aa  65.1  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  30.95 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  29.03 
 
 		 143 aa  57  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  27.27 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1284  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.155543  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 166 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  27.5 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.7 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 148 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 177 aa  52.4  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 296 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  26.67 
 
 		 165 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 161 aa  51.6  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  24.2 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  27.2 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 170 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  27.69 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  27.13 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  25.36 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1311  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 192 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  26.55 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 197 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  28.07 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  26.56 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0087  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 177 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>