More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3727 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
150 aa  301  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2467  MarR family transcriptional regulator  79.73 
 
 
158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411287  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  77.7 
 
 
158 aa  234  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  53.62 
 
 
147 aa  156  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  45.65 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
147 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2008  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
214 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  43.21 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  33.59 
 
 
171 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  43.3 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0779  MarR family transcriptional regulator  46.05 
 
 
167 aa  67  0.00000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4007  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
184 aa  67.4  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2522  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.46 
 
 
292 aa  65.1  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  33.61 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26700  transcriptional regulator  34.38 
 
 
166 aa  63.9  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347504  normal  0.248869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3367  transcriptional regulator, MarR family  32.85 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
168 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 
157 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  34.92 
 
 
145 aa  62  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  33.82 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4392  Transcriptional regulators-like protein  35.9 
 
 
168 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00709871  normal  0.0557169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  29.85 
 
 
177 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  44.93 
 
 
154 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
138 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
145 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  35.64 
 
 
206 aa  60.1  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
172 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  33.86 
 
 
158 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25.95 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
151 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4112  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0425216  normal  0.0879154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3564  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.352306  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
174 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
205 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
176 aa  54.3  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.45 
 
 
165 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2867  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 
152 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322809  normal  0.0426996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
166 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 
157 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  30.95 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 
171 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  23.64 
 
 
149 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
182 aa  53.9  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
180 aa  53.5  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
170 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
178 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 
173 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
167 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1197  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 
182 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.308102  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  32.47 
 
 
161 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
152 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  33.02 
 
 
141 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 
155 aa  52  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 
170 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
157 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  38.74 
 
 
157 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
140 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  31.43 
 
 
168 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
170 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2040  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.220798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>