More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0238 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 155 aa  313  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2470  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  41.67 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  33.05 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 178 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  29.58 
 
 		 312 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  36.17 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  42.05 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 148 aa  51.2  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  30.26 
 
 		 160 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2241  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.117879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1511  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 175 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1698  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 203 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  35.71 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 140 aa  48.5  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 201 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  35.71 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 152 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00880  transcriptional regulator, MarR family  32.53 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  30.36 
 
 		 144 aa  48.1  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  36.99 
 
 		 201 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0304  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.272256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  36.99 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 136 aa  47.8  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 206 aa  47.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.08 
 
 		 325 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  25.42 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 		 141 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 		 159 aa  47.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.19 
 
 		 167 aa  47.4  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0281  regulatory protein MarR  28.99 
 
 		 187 aa  47.4  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.136953  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 152 aa  47.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 324 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>