129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0032 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  35.42 
 
 		 178 aa  84.7  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3618  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.571227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1973  transcriptional regulator, MarR family  38.85 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00891975  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  36.44 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  31.85 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 156 aa  51.6  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  33.98 
 
 		 156 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  36.08 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 157 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 155 aa  48.5  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 168 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 155 aa  48.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 140 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 169 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 166 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 175 aa  46.2  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 162 aa  45.8  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 137 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 168 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  32.32 
 
 		 160 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  30.17 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 140 aa  45.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 154 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 149 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 145 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 162 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0254  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 166 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1148  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 142 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  37.14 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  40.28 
 
 		 164 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2731  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  30.23 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 160 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  34.95 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  62.5 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.4 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  42.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 151 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 167 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 152 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1297  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 132 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2486  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0993114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  27.14 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 175 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>