More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2637 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  56.38 
 
 		 152 aa  179  9.000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  41.09 
 
 		 151 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  37.68 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  30.41 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  42.17 
 
 		 167 aa  69.3  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  33.66 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.33 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  33.68 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1499  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364247  normal  0.593095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 168 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  30.93 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  30.36 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 167 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  30.1 
 
 		 189 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0050  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4437  Transcriptional regulators-like protein  27.54 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0232347  hitchhiker  0.00593821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3000  MarR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0270  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 203 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.46 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  43.55 
 
 		 201 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  28.69 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.14 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 178 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3141  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.566984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  27.89 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4941  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497711  normal  0.847293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  36.99 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  29.37 
 
 		 324 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 169 aa  51.2  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 162 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4364  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 308 aa  51.2  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258723  normal  0.018546 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2675  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  26.13 
 
 		 187 aa  50.8  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  39.06 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 200 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 151 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  25.45 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 160 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  31.52 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>