255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0044 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  45 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 147 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  41.88 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.94 
 
 		 127 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 157 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 146 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  38.83 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  43.69 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  39.77 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  38.14 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  37.86 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  36.72 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  38.2 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  47.14 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  54.3  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 145 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  33.65 
 
 		 153 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 158 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 149 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 148 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 		 150 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 151 aa  52  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 145 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 157 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 138 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 172 aa  51.2  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 165 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 303 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  32.82 
 
 		 144 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 135 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39.13 
 
 		 173 aa  49.3  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 171 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2611  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.38 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 145 aa  48.5  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 166 aa  48.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 173 aa  48.1  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 140 aa  48.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>