More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2620 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
148 aa  102  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
148 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
148 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
148 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
148 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  36.23 
 
 
148 aa  98.2  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
148 aa  97.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
182 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
147 aa  88.6  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 
152 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1190  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
155 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
148 aa  62  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
140 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 
153 aa  60.5  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2362  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.438216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1309  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
136 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  22.7 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  32.04 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1439  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
140 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.207252  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3527  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
173 aa  58.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3904  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
150 aa  57.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  29 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
139 aa  57  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
158 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  27.86 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.46 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 
167 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 
139 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 
146 aa  55.1  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
156 aa  54.7  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 
167 aa  54.7  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
141 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
171 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
159 aa  54.3  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
204 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
151 aa  54.3  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  36.49 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0818  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
160 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
144 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2438  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0147393  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 
160 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 
161 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  32.61 
 
 
157 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  21.64 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 
159 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 
141 aa  52  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 
147 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
137 aa  52.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  24.81 
 
 
142 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>