More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2570 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  312  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  59.85 
 
 		 189 aa  150  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 155 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  64.41 
 
 		 190 aa  141  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  44.76 
 
 		 153 aa  90.5  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.01 
 
 		 139 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1958  MarR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.21 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  40.59 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 146 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0830  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.170998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  35.16 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1223  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.34 
 
 		 312 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1112  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 140 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2543  transcriptional regulator, TrmB  29.92 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.751029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  33.71 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  29.92 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3833  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.489969 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3946  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 194 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0859911 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 186 aa  51.2  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 187 aa  51.2  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 204 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  40.51 
 
 		 165 aa  50.8  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  37.18 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 145 aa  50.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  44 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 151 aa  50.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 164 aa  50.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 143 aa  50.8  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.96 
 
 		 326 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2189  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  35.64 
 
 		 325 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4745  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427221 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0021  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  36.45 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 147 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3668  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.620653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1506  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1299  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.541752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1272  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.610251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1273  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.071067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1406  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1545  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00793933  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1477  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  40.32 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  34.83 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  36.61 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0883  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.29 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_003296  RS02009  putative transcription regulator protein  29.5 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.644925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  33.68 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 320 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 177 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2956  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>