More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4152 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 135 aa  258  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  36.59 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2365  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000820566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  38.78 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  40.35 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  38.39 
 
 		 172 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  26.17 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 158 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  42.86 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  34.96 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  37.72 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4196  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  44.58 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 148 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 169 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1302  transcriptional regulator, MarR family  33.7 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.19 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3051  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.193524  hitchhiker  0.00149188 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0047  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0038  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 136 aa  54.3  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0962  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000434573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0871  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0438869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 164 aa  52.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1106  MarR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0045  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17709  normal  0.0234006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  21.5 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2764  transcriptional regulator, MarR family  38.37 
 
 		 199 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0619086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 142 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1601  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  40.24 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  51.2  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 213 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 137 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 169 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>