170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2122 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2122  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
165 aa  323  8.000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.772041  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  50.99 
 
 
162 aa  141  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  43.93 
 
 
155 aa  80.1  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6002  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.431751  normal  0.0431978 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2306  transcriptional regulator, TrmB  39.68 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
168 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.02 
 
 
149 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 
187 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  24.65 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  27.91 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 
151 aa  52  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2149  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 
150 aa  51.6  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176051  normal  0.0619167 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1251  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
155 aa  50.8  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 
147 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  47.37 
 
 
144 aa  50.8  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1747  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17088  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
147 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  45.61 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
189 aa  48.5  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1368  transcriptional regulator, MarR family  34.91 
 
 
170 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
208 aa  48.1  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2339  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
151 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 
139 aa  47.8  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
159 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5537  transcriptional regulatory protein  37.18 
 
 
161 aa  47.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.91468  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.69 
 
 
154 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  38.67 
 
 
140 aa  47  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  32.5 
 
 
145 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5035  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1398  normal  0.0159957 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  36.67 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
171 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.67 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
162 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3922  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462082  normal  0.0695872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  26.23 
 
 
138 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4033  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3866  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0257058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4348  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.47 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  33.67 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
163 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
143 aa  44.3  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0789  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.268578  hitchhiker  0.00472645 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
165 aa  44.3  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0846  regulatory protein, MarR  35.71 
 
 
185 aa  44.3  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3880  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230852  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  32.93 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
143 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2084  transcriptional regulator, MarR family  23.58 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000746204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
155 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.57 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
142 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3956  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4149  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4259  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4235  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1001  transcriptional regulator, MarR family  27.01 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  30 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
143 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>