More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5835 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5835  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  276  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 190 aa  77.8  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 138 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 172 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  32.79 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2828  regulatory protein MarR  24.17 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2750  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.395044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  37.96 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 155 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1028  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.663158  hitchhiker  0.00390139 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.68 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  33.94 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  35.4 
 
 		 196 aa  53.9  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 219 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  32.84 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 172 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  32.2 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  34.45 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  46.88 
 
 		 143 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0803  transcriptional regulator, MarR family  27.94 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4143  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 158 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307791  hitchhiker  0.00487322 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 172 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  34.02 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4463  hypothetical protein  32.33 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0202449  hitchhiker  0.00964161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  31.15 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 165 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  34.02 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1078  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 165 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 164 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 156 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 172 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  28.68 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 164 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 181 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 150 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 163 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  31.86 
 
 		 324 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 161 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 193 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 156 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2532  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  26.45 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.16 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2022  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>