296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4708 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  284  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  284  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  70.71 
 
 		 152 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 142 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  67.14 
 
 		 144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  67.38 
 
 		 144 aa  179  9.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 146 aa  161  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 143 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  57.55 
 
 		 143 aa  157  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  22.94 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 303 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.13 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3737  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1463  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 182 aa  51.6  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 168 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.37 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 161 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4909  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 166 aa  50.4  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 171 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  26.72 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  35.51 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  29.73 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 146 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  31.69 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 		 173 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  29.79 
 
 		 159 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 155 aa  47  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  30.77 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  34.21 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3240  MarR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.715513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  21.7 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>