97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4909 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4909  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
144 aa  273  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2611  transcriptional regulator, MarR family  48.18 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000285169  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4708  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.155133  decreased coverage  0.00302291 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3631  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.98 
 
 
142 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
143 aa  51.6  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  36.7 
 
 
167 aa  50.8  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
142 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 
147 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
151 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  24.41 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
143 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
143 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0494  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.45 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  23.62 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
159 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  37.08 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  36.17 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  36.17 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
160 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4527  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  36.17 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2575  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000352452  normal  0.108495 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
143 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  31.37 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4318  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3178  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
203 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0352052  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  35.71 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0510  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
157 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.100166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0532  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  23.62 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0520  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  36.47 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
161 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 
154 aa  42  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  35.11 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  26.74 
 
 
156 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3618  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
201 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  32.76 
 
 
135 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  22.64 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23820  transcriptional regulator  39.51 
 
 
149 aa  40.8  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
145 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  22.13 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  20.3 
 
 
167 aa  40.8  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.34 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  37.14 
 
 
162 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
169 aa  40.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  31.9 
 
 
145 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
142 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2407  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
167 aa  40  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.445055  normal  0.878491 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
149 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 
160 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 
159 aa  40  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>