More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2011 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  313  8e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  35.8 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  39.24 
 
 		 162 aa  57  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  39.24 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4585  regulatory protein MarR  37.97 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.1 
 
 		 324 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.57 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1966  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000123545  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0308  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000768175  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 146 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2232  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00982992  hitchhiker  0.00000264817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 185 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  32 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  34.57 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06220  transcriptional regulator, MarR family  36.71 
 
 		 169 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  35.8 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  31.91 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  27.05 
 
 		 153 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  35.29 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.71 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.6 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1979  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.293759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  27.38 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  35.14 
 
 		 180 aa  48.1  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 140 aa  48.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 176 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 214 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 154 aa  47.8  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  34.57 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0649  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 161 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 334 aa  47.4  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4312  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3873  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  29.89 
 
 		 141 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0504878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  32.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 212 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.32 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2661  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00131118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>