72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0921 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
176 aa  350  8e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  95.45 
 
 
176 aa  337  7e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
158 aa  310  4.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 
157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 
175 aa  70.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 
174 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 
164 aa  62  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  31.62 
 
 
173 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  31.53 
 
 
152 aa  58.2  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  35.71 
 
 
165 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  28.87 
 
 
141 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
192 aa  52.8  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  36.9 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 
152 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2174  regulatory protein, MarR  36.11 
 
 
133 aa  50.4  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  31.94 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  38.64 
 
 
188 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2011  transcriptional regulator  25.41 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
160 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
163 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1429  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
198 aa  47.8  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
172 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
165 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
315 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5455  hypothetical protein  32.47 
 
 
180 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
310 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
171 aa  45.4  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  26.9 
 
 
161 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 
170 aa  44.7  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
142 aa  44.3  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2110  regulatory protein, MarR  32.35 
 
 
163 aa  43.9  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.450646  normal  0.261342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  22.33 
 
 
313 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 
189 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  42.86 
 
 
160 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  30.53 
 
 
164 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  29.55 
 
 
206 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0498  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000167628  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
141 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
150 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
165 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
178 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
174 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 
165 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  25.32 
 
 
283 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
150 aa  42  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
149 aa  41.6  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 
161 aa  41.6  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  32.93 
 
 
326 aa  41.6  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
223 aa  41.6  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  21.28 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2351  regulatory protein, MarR  37.7 
 
 
166 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.375584  normal  0.032917 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.88 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  24.83 
 
 
146 aa  41.6  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1076  transcriptional regulator  34.21 
 
 
134 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.334697  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
147 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.14 
 
 
154 aa  41.2  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 
309 aa  41.2  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
173 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2134  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30 
 
 
322 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>