More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2795 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  57.14 
 
 
140 aa  166  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
148 aa  136  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  36.88 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
145 aa  104  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 
139 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
141 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 
149 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 
139 aa  100  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
139 aa  100  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
139 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
168 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 
156 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 
159 aa  87.8  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 
147 aa  84.7  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 
149 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
161 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.54 
 
 
142 aa  77.4  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  32.33 
 
 
162 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.79 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.03 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 
192 aa  73.9  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  31.58 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2019  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0237275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1454  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0425619  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
157 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
164 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
174 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3167  transcriptional regulator, putative  30.88 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.841227  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.83 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  26.09 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
137 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  26.09 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
148 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  25.9 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  31.58 
 
 
151 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 
149 aa  67.4  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 
148 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
163 aa  67  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1537  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510368  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
315 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
150 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
198 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
205 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  34.48 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
157 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
160 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
157 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
167 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  33.64 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3747  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
181 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0512718  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  40.96 
 
 
151 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  25.76 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  34.04 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>