More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0707 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  100 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0777  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  42.25 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0280  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5112  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.522104  normal  0.0529869 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0651  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  31.97 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  31.86 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0464  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0089  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  54.3  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2285  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.864353  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  28.06 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3093  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2003  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0424  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.476244  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0404  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0144354  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0586  MarR family regulatory protein  36.27 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.7562  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8732  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7166  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 187 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.567049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  38.67 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0178  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 193 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 315 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0501  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0851191  normal  0.700871 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  24.81 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  32.71 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 164 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.45 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  29.57 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 162 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 174 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1844  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1105  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00926589  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4489  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  40.22 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>