More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5540 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5540  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 148 aa  297  3e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.971707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  46.27 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  34.71 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1287  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0811  transcriptional regulator, MarR family  28.23 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.770437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 158 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3933  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 144 aa  67.8  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 168 aa  62  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4809  MarR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.752918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2782  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00307717  normal  0.0921189 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4961  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 192 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0717313  normal  0.154952 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1579  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.359907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6318  transcriptional regulator, MarR family  26.02 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  26.56 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  26.83 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  26.15 
 
 		 139 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 160 aa  57  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 142 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4622  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  37.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  31 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  26.89 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 153 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 177 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  39.73 
 
 		 162 aa  52.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  30 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  26.45 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  38.33 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4103  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.595452 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3111  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 137 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  36.9 
 
 		 158 aa  51.2  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  28.57 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  42.62 
 
 		 143 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 142 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>