77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0629 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 160 aa  328  3e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  32.17 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1265  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 163 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000976075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 180 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  43.28 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 150 aa  47.4  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  41.33 
 
 		 127 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  39.53 
 
 		 173 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3893  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.12829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.32 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4909  transcriptional regulator, MarR family  41.25 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  40.28 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 		 152 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 147 aa  44.3  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.0009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3831  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 172 aa  43.9  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1623  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0513961  normal  0.0977166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 159 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.93 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3659  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 162 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  41.51 
 
 		 171 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5298  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 142 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 170 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  32.93 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 212 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3476  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 155 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125769  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 153 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0282  MarR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.486948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1028  transcriptional regulator, MarR family  29.35 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 201 aa  41.6  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 150 aa  42  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  42  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3979  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 165 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 156 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1208  MarR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4279  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 161 aa  41.2  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0560787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  38.55 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  34.88 
 
 		 292 aa  40.8  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 193 aa  40.8  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 178 aa  40.8  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 156 aa  40.8  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07740  transcriptional regulator  27.88 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.339553 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 149 aa  40.8  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 141 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  27.18 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  39.58 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>