238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2109 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 145 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  53.1 
 
 		 197 aa  139  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 208 aa  134  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  43.66 
 
 		 207 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  38.73 
 
 		 206 aa  106  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 212 aa  103  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 214 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 		 196 aa  95.1  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  93.6  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 270 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 270 aa  92.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 213 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 270 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 270 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 200 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 200 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 270 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 196 aa  90.5  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 224 aa  90.5  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 191 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 189 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  60.8  0.000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 192 aa  60.5  0.000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  32.64 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1342  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 161 aa  52  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  44.16 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  44.44 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4521  transcriptional regulator, MarR family  51.79 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.586823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  25.81 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  49.06 
 
 		 154 aa  48.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  50 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  35.24 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  26.51 
 
 		 146 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3523  transcriptional regulator, TrmB  37.21 
 
 		 162 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.503632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 189 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  41.03 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 173 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  45.45 
 
 		 171 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3133  transcriptional regulator, MarR family  53.85 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0629  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0229428  normal  0.101426 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  45.28 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 158 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4274  MarR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  47.27 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0998  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000450999  hitchhiker  0.00423062 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4070  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 185 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  52 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  41.1 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  38.3 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 189 aa  44.7  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  41.27 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  44.23 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.65 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4152  transcriptional regulator, MarR family  47.92 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.706561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>