34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0550 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  100 
 
 		 175 aa  346  7e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  32.28 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  31.14 
 
 		 218 aa  62  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  27.17 
 
 		 206 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 153 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  25.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 270 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 200 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 270 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  26.11 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  26.38 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 270 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 167 aa  42  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 147 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1279  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 150 aa  41.6  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 191 aa  41.6  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 167 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  34.43 
 
 		 146 aa  41.2  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 167 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 167 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  42.42 
 
 		 165 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1235  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 144 aa  40.8  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.236148  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>