More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_52070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  87.1 
 
 		 186 aa  332  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 189 aa  223  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3772  MarR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 181 aa  189  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.064447  normal  0.0771773 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  53.51 
 
 		 190 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 189 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4905  putative transcriptional regulator  44.38 
 
 		 184 aa  160  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2690  MarR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0658  MarR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 191 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0565  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1921  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  25.57 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  31.29 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 141 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 159 aa  52.8  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 270 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 270 aa  52  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3853  regulatory protein, MarR  29.41 
 
 		 162 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295322  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3485  transcriptional repressor MprA  34.82 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 167 aa  51.6  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25260  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 158 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2508  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132261  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1318  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1354  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3032  transcriptional regulator, MarR family  40.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0797104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1582  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 143 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2233  transcriptional regulatory protein  29.69 
 
 		 151 aa  49.3  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5382  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 159 aa  49.3  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2691  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759324 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  27.96 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  29.03 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2132  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.151362  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2794  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2744  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 148 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.43 
 
 		 170 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 178 aa  48.5  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1328  MarR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  29.46 
 
 		 171 aa  48.5  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 157 aa  48.5  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 314 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  31.78 
 
 		 176 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2770  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 148 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 165 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 137 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  47.8  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30.84 
 
 		 176 aa  47.8  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3683  transcriptional regulator, MarR family  39.51 
 
 		 153 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1281  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 134 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.781724  normal  0.841925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  35.83 
 
 		 147 aa  47.4  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0542  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1241  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 134 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal  0.852338 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 270 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5817  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.127726 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  31.25 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 154 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3884  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0832  MarR family regulatory protein  38.81 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>