52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2911 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2911  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.233066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  30.46 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4139  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0210  MarR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.133838 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0070  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3251  MarR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0003  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0838682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4421  transcriptional regulator, MarR family  28.95 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.636596  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2985  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0529502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0070  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0061  MarR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0088  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.519459 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0069  MarR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.373152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  29.12 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  27.84 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3063  MarR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.565179  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 270 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3344  MarR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0213  MarR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4012  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4084  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.574763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  24 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2109  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 145 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0550  regulatory protein, MarR  30.22 
 
 		 175 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0117945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4567  transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.424038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 187 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1762  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52070  transcriptional regulator  23.91 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0119857 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0228  MarR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3267  transcriptional regulator, MarR family  22.11 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0504  transcriptional regulator, TrmB  26.71 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.21026 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1088  MarR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1765  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  31.48 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1503  MarR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.481743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3577  putative transcriptional regulator  30.23 
 
 		 136 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 142 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 160 aa  42.4  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 171 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4209  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0466209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 160 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>